Pn-Pt 10:00 - 16:00 
Najnowszy wyrok Naczelnego Sądu Administracyjnego przynosi słodko-gorzkie wieści dla firm korzystających z ulgi B+R i podkreśla, jak kluczowe jest prawidłowe przygotowanie kalkulacji, aby bez problemu przejść ewentualny audyt podatkowy. Sąd potwierdził, że wynagrodzenia za urlop i chorobę kwalifikują się do ulgi, ale jednocześnie narzucił mniej korzystny sposób liczenia proporcji czasu pracy, co może zmniejszyć wysokość odliczenia.
Wynagrodzenia za Urlop i Chorobę – Zielone Światło od NSA
Dobra wiadomość jest taka, że NSA ostatecznie potwierdził prawo do uwzględniania w kosztach kwalifikowanych ulgi B+R wynagrodzeń pracowników za czas urlopu i zwolnienia chorobowego. Stanowisko to jest zgodne z wcześniejszą linią orzeczniczą oraz interpretacją ogólną Ministra Finansów z 13 lutego 2024 r.. Fiskus nie ma więc podstaw prawnych do kwestionowania tych składników wynagrodzenia.
Jak Liczyć Czas Pracy? Tu Kryje się Ryzyko
Prawdziwym polem sporu okazał się sposób obliczania proporcji, w jakiej wynagrodzenia można zaliczyć do kosztów kwalifikowanych. Zgodnie z przepisami, koszty te uwzględnia się w takiej części, w jakiej „czas przeznaczony na realizację działalności badawczo-rozwojowej pozostaje w ogólnym czasie pracy pracownika w danym miesiącu”. Spór dotyczył definicji „ogólnego czasu pracy”:
- Podejście korzystne (prezentowane przez WSA): „Ogólny czas pracy” to czas faktycznie przepracowany w miesiącu, po odjęciu nieobecności. To zwiększało proporcję B+R, a tym samym kwotę ulgi.
- Podejście niekorzystne (potwierdzone przez NSA): „Ogólny czas pracy” to nominalny wymiar czasu pracy, czyli liczba godzin, które pracownik powinien przepracować w danym okresie zgodnie z umową, bez względu na nieobecności.
NSA uznał, że należy stosować drugie podejście, co jest dla firm mniej korzystne. Przykładowo, jeśli pracownik z nominalnych 160 godzin w miesiącu poświęca 40 na B+R i przez 80 godzin choruje, to według NSA proporcja wyniesie 25% (40/160), a nie 50% (40/80), jak chciałby podatnik. Prawidłowość tej kalkulacji to jeden z kluczowych elementów, na które zwróci uwagę audyt podatkowy.
Niepewność Prawna i Apel do Ministra Finansów
Eksperci zgodnie podkreślają, że cały spór jest wynikiem nieprecyzyjnych przepisów i „niefrasobliwości ustawodawcy”. Obecnie trudno jednoznacznie odgadnąć intencje, jakie stały za taką konstrukcją przepisów, co zostało pominięte w interpretacji ogólnej MF. Dlatego pojawiają się głosy, że Minister Finansów powinien wydać objaśnienia, które ujednolicą praktykę i zapewnią przedsiębiorcom pewność prawa.
Jak Przygotować Firmę na Audyt Podatkowy Ulgi B+R?
Wyrok NSA jest jasnym sygnałem, że firmy muszą podchodzić do kalkulacji ulgi B+R z dużą ostrożnością. Aby zminimalizować ryzyko sporu z fiskusem, zalecane jest stosowanie metody wskazanej przez NSA, czyli liczenie proporcji w odniesieniu do nominalnego czasu pracy. Jeśli masz wątpliwości, jak prawidłowo rozliczyć ulgę, doradca podatkowy w Katowicach pomoże Ci przygotować dokumentację i kalkulacje, które obronią się w razie kontroli. Profesjonalne wsparcie to najlepszy sposób, by uniknąć bolesnych w skutkach postępowań podatkowych.
